Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PKHD1P08F94 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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