Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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FOXD2O60548 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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FOXD2O60548 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD2O60548 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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