Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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SOBPA7XYQ1 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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SOBPA7XYQ1 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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SOBPA7XYQ1 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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SOBPA7XYQ1 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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SOBPA7XYQ1 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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