Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
COPS7AQ9UBW8 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms