Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms