Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PDGFDQ9GZP0 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDGFDQ9GZP0 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms