Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms