Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CTXN3Q4LDR2 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms