Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PTPROQ16827 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPROQ16827 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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