Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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PCSK7Q16549 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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PCSK7Q16549 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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PCSK7Q16549 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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PCSK7Q16549 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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PCSK7Q16549 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PCSK7Q16549 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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