Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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