Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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VAMP3Q15836 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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VAMP3Q15836 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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VAMP3Q15836 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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VAMP3Q15836 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
VAMP3Q15836 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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