Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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