Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SMCO1Q147U7 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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