| RUNX2 | Q13950 | AP001021.1-201 | ENST00000577704 | 244 nt | TSL 3 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090616.5-202 | ENST00000582111 | 297 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DTNA-232 | ENST00000599844 | 853 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090186.1-201 | ENST00000605991 | 572 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC064801.1-201 | ENST00000612025 | 407 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR10A6-202 | ENST00000623991 | 945 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC055839.1-201 | ENST00000634467 | 498 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF382-210 | ENST00000639288 | 834 nt | TSL 5 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR52H1-202 | ENST00000641796 | 1061 nt | BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ENPP2-202 | ENST00000259486 | 3233 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010186.3-201 | ENST00000537616 | 2508 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | VIM-AS1-201 | ENST00000437232 | 1351 nt | TSL 2 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MGAT4C-202 | ENST00000548651 | 2159 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PHEX-201 | ENST00000379374 | 6172 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00158-201 | ENST00000332587 | 1476 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CNOT1-201 | ENST00000317147 | 8471 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | XKR3-201 | ENST00000331428 | 1690 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.97 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PIKFYVE-201 | ENST00000264380 | 9901 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356473.1-201 | ENST00000406203 | 1408 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AJ009632.2-204 | ENST00000635621 | 1401 nt | TSL 5 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.77 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RANBP6-201 | ENST00000259569 | 4576 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF43-210 | ENST00000598381 | 3004 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01902-202 | ENST00000636983 | 4607 nt | TSL 5 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KCNJ16-211 | ENST00000615244 | 4190 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | USP34-201 | ENST00000398571 | 11357 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U3.4-201 | ENST00000363352 | 213 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-501P-201 | ENST00000364072 | 100 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-24P-201 | ENST00000364565 | 139 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068538.1-201 | ENST00000376856 | 336 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.493-201 | ENST00000384422 | 102 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF705D-201 | ENST00000400078 | 925 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1179-201 | ENST00000408703 | 91 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL133480.1-201 | ENST00000411561 | 638 nt | TSL 2 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGB1P11-201 | ENST00000413899 | 637 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EIF4EP1-201 | ENST00000422311 | 642 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP38-201 | ENST00000423801 | 469 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BTF3P10-201 | ENST00000433415 | 495 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MRPS18BP2-201 | ENST00000434310 | 759 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCYBP45-201 | ENST00000435243 | 565 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HLA-N-201 | ENST00000437516 | 135 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP89-201 | ENST00000439324 | 255 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAR2P1-203 | ENST00000440931 | 187 nt | TSL 2 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000936.2-201 | ENST00000447151 | 681 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01474-202 | ENST00000449235 | 628 nt | TSL 3 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL645939.1-201 | ENST00000453429 | 797 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS20P24-201 | ENST00000457473 | 361 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010469.1-201 | ENST00000463864 | 576 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL365356.5-201 | ENST00000478294 | 697 nt | TSL 2 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068587.1-201 | ENST00000483613 | 781 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00492-201 | ENST00000504436 | 593 nt | TSL 3 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PPBPP1-201 | ENST00000510807 | 373 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAPPC2P2-201 | ENST00000517589 | 409 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090739.1-201 | ENST00000522190 | 708 nt | TSL 3 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090281.1-201 | ENST00000523019 | 276 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR5AP1P-201 | ENST00000529730 | 940 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL139174.1-201 | ENST00000531489 | 886 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02235-201 | ENST00000534675 | 466 nt | TSL 5 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL133166.1-201 | ENST00000551040 | 1034 nt | TSL 4 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023161.2-201 | ENST00000551218 | 780 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025265.2-201 | ENST00000551905 | 478 nt | TSL 3 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCMTD1P2-201 | ENST00000565017 | 355 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091489.2-201 | ENST00000566263 | 604 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL121834.1-201 | ENST00000572284 | 509 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR5186-201 | ENST00000577504 | 120 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC100872.1-201 | ENST00000577765 | 501 nt | TSL 5 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR544B-201 | ENST00000582372 | 78 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010649.1-203 | ENST00000592230 | 454 nt | TSL 2 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF28-207 | ENST00000594602 | 684 nt | TSL 5 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U73023.1-201 | ENST00000603134 | 700 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC103710.4-201 | ENST00000609301 | 899 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DLEU1_2.1-201 | ENST00000617920 | 342 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CCL14-203 | ENST00000620991 | 426 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC139792.2-201 | ENST00000624218 | 587 nt | BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EVI5-208 | ENST00000540033 | 7436 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ERICH3-AS1-202 | ENST00000612390 | 4874 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRIT3-202 | ENST00000594814 | 3566 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ADAM29-201 | ENST00000359240 | 3325 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GYPA-202 | ENST00000360771 | 2659 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAPK10-353 | ENST00000641803 | 8483 nt | APPRIS P2 BASIC | 3.96 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02456-201 | ENST00000635615 | 1323 nt | TSL 5 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRRC63-203 | ENST00000595396 | 2327 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DMXL2-202 | ENST00000449909 | 7465 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ENPP3-202 | ENST00000358229 | 3026 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01247-201 | ENST00000448901 | 4209 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR56A3-203 | ENST00000641160 | 4438 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATP2B1-202 | ENST00000359142 | 6977 nt | TSL 5 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353746.1-201 | ENST00000566293 | 6881 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TAB3-204 | ENST00000378932 | 3698 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SPA17-201 | ENST00000227135 | 853 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU5F-6P-201 | ENST00000362979 | 116 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-821P-201 | ENST00000390995 | 107 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL31-205 | ENST00000409320 | 716 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091705.1-201 | ENST00000412197 | 209 nt | TSL 5 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01362-201 | ENST00000419658 | 338 nt | TSL 5 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004946.1-201 | ENST00000421825 | 751 nt | TSL 3 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC244098.2-201 | ENST00000422068 | 99 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL096799.1-201 | ENST00000425900 | 381 nt | TSL 2 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LAMTOR3P1-201 | ENST00000428620 | 370 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00392-201 | ENST00000430033 | 557 nt | TSL 3 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRIM60P9Y-201 | ENST00000438459 | 816 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |