Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE7AQ13946 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms