Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
KLF9Q13886 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.7 ms