Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKP1Q13835 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms