Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms