Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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SF3B2Q13435 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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SF3B2Q13435 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SF3B2Q13435 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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