Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms