Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.97
SKP2Q13309 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.5 ms