Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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