Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTGDRQ13258 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTGDRQ13258 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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