Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms