Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DUSP4Q13115 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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