Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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CHAF1BQ13112 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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CHAF1BQ13112 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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CHAF1BQ13112 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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