Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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GPS1Q13098 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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