Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PRDM2Q13029 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PRDM2Q13029 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms