Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
BPTFQ12830 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
BPTFQ12830 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
BPTFQ12830 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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