Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
IFFO1Q0D2I5 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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