Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD8P13378 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.1 ms