Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRFP10586 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRFP10586 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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