Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SOBPA7XYQ1 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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