Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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CCDC93Q567U6 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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CCDC93Q567U6 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC93Q567U6 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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