Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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