Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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