Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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DDB1Q16531 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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DDB1Q16531 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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DDB1Q16531 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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DDB1Q16531 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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DDB1Q16531 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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DDB1Q16531 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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