Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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CNGA3Q16281 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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CNGA3Q16281 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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CNGA3Q16281 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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CNGA3Q16281 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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CNGA3Q16281 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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CNGA3Q16281 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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CNGA3Q16281 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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