Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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