Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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SYCP1Q15431 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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SYCP1Q15431 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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SYCP1Q15431 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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SYCP1Q15431 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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SYCP1Q15431 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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SYCP1Q15431 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SYCP1Q15431 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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