Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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PTPRRQ15256 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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PTPRRQ15256 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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PTPRRQ15256 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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PTPRRQ15256 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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PTPRRQ15256 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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PTPRRQ15256 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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PTPRRQ15256 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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PTPRRQ15256 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPRRQ15256 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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