Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PCOLCEQ15113 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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