Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
R3HDM1Q15032 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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