Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NAE1Q13564 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms