Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
NEUROD1Q13562 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NEUROD1Q13562 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms