Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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