Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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