Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ITGB3BPQ13352 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms