Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SEMA3FQ13275 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms